انتشار صورتهای مالی هلدینگ خلیج فارس در بازار سرمایه ایران با حواشی و ابهامات فراوانی همراه شده است. دیوان محاسبات کل کشور برای نخستینبار در تاریخ مالی ایران نسبت به خطرات تصویب این صورتهای مالی هشدار داد و مجمع شرکت را ۱۰ روز به تعویق انداخت. بند جنجالی این گزارش، شناسایی سود ۹۰۰ میلیون دلاری از محل مطالبات پتروشیمی ایلام است که هنوز وصول نشده است. این در حالی است که پتروشیمی ایلام به تازگی از زیاندهی خارج شده و سازوکار وصول این مبلغ در سال مالی منتهی به خرداد ۱۴۰۵ مشخص نیست. پیامد مستقیم این اقدام، صدور برگه مالیاتی ۲۲۵ میلیون دلاری توسط سازمان امور مالیاتی برای سودی است که هنوز به دست نیامده است. رسانه «مشرقنیوز» با انتقاد از این تصمیم مدیران هلدینگ، آمادگی خود را برای شفافسازی جزئیات این سود اعلام کرده است.