اختلافات تازه میان ترکیه و جمهوری آذربایجان بر سر مسائل گوناگون از جمله موضوع حجاب در باکو، همکاری‌های انرژی و روابط با اسرائیل ابعاد پیچیده‌ای پیدا کرده است. علی قائم‌مقامی، کارشناس مسائل ترکیه، اعلام کرد که محرومیت دانش‌آموزان و معلمان محجبه از تحصیل و اشتغال در جمهوری آذربایجان و تمایل این کشور برای پیاده‌سازی نظام آموزشی اسرائیل، واکنش شدید احزاب اسلام‌گرا و ملی‌گرا در ترکیه را به همراه داشته است. این انتقادات گسترده موجب موضع‌گیری تند مقام‌های ترکیه‌ای و سپس واکنش الهام علی‌اف شد که بر استقلال کشورش و عدم مداخله ترکیه در امور داخلی تأکید کرد. با وجود عقب‌نشینی نسبی دولت اردوغان به دلیل فشارهای سیاسی داخلی، احتمال افزایش تنش میان دو کشور همچنان وجود دارد. یکی از محورهای چالش‌برانگیز دیگر، تهدید الهام علی‌اف به عدم شرکت در نشست کاپ ۳۱ به میزبانی ترکیه است. این مناقشات دیپلماتیک نشان‌دهنده عمق‌یابی چالش‌های سیاسی میان آنکارا و باکو در حوزه‌های مختلف فرهنگی و منطقه‌ای است.
