مدیریت تنوع زیستی در کشور با چالشهای ساختاری و اجرایی متعددی مواجه است که مهمترین آن گسست میان دستگاههای متولی محسوب میشود. یک عضو هیئت علمی دانشگاه تربیت مدرس بر ضرورت توجه به ظرفیتهای اکولوژیک در مدیریت تنوع زیستی کشور تاکید کرد. وی گسست مدیریتی میان دستگاههای متولی رویشگاهها و زیستگاهها را یکی از چالشهای اصلی حفاظت از طبیعت دانست. به گفته این متخصص، حفاظت اصولی از منابع طبیعی نیازمند هماهنگی میان نهادهای مسئول است. مدیریت گونههای جانوری و گیاهی باید بر اساس نیازهای اکولوژیک و زنجیره حیات آنها انجام شود تا از تخریب بیشتر زیستگاهها جلوگیری به عمل آید.