ناشران ایرانی با پولی شدن صدور شابک روبرو هستند. حدود ۱۶ هزار ناشر عضو نظام شابک هستند و هر شماره با هزینه ۵۵ هزار تومان صادر می‌شود. مدیرعامل خانه کتاب و ادبیات ایران اعلام کرد سالانه بیش از ۱۰۰ هزار شابک صادر می‌شود. ناشران به دلیل شفاف نبودن مبنای دریافت هزینه و خدمات فراتری که دریافت می‌کنند، نگران هستند. آژانس بین‌المللی شابک قیمت واحدی برای صدور این شناسه تعیین نمی‌کند و تعیین تعرفه به سیاست‌های هر کشور بستگی دارد. نظام شابک در سال ۱۹۶۶ در انگلیس شکل گرفت و از سال ۲۰۰۷ به ساختار ۱۳ رقمی تغییر یافت.
